無菌均質器工作原理是將原始樣本（大的需要剪成約10×10mm塊狀），與某種液體或溶劑放入均質袋，經無菌均質器的錘擊板反復在樣品均質袋上錘擊，產生壓力、引起振蕩、加速混合、從而達到溶液中微生物成分處于均勻分布狀態。無菌均質器適用于腦、腎、肝、脾等組織及微生物的均質處理，廣泛應用于食品、藥品、臨床、分子學、毒素及細菌檢測等領域。 存放原始樣品物質和溶劑的均質袋，由特殊材料制成，已無菌處理（已開封的均質袋用戶應再次消毒滅菌以確保無菌），通過均質器門上沿部位的橫桿進行裝夾密封，可避免在錘擊板錘擊時溶液的溢出，均質器的拍擊板不停地在均質袋上錘擊，產生的壓力可將袋中的樣品擊碎混勻。均質速度可編程設定，每段可設3~12次/秒，均質時間每一段可設定為1秒~100分鐘或連續運行，用戶可根據樣品和溶劑情況進行合理的選擇，以達到最佳的均質效果。例如：小鼠、大鼠的肝臟定時設3分鐘，中速6~10次/秒即可。 無菌均質器主要操作步驟如下： 1、準備好預處理的樣品，裝入無菌均質袋中； 2、打開均質器的門,將無菌均質袋開口部分在關門時夾住（自動）； 3、設定好程序如拍擊速度、拍擊時間等； 4、開始自動工作；勻質完畢，打開倉門取出處理完畢的樣品。至此工作完畢。