自動菌落計數儀可用于細菌、酵母菌和未擴散霉菌的計數，適用于傾注平板、涂布平板，以及膜濾平板。可用于等效直徑小于25mm的長形或圓形的菌落計數。計數速度為150～800粒/s，對于2mm直徑以內的菌落，只需計算1秒便完成800粒計數，采用批量數粒分析模式，每小時可完成400個樣品的分析。
    1、將菌落存放平皿放在拍攝平臺上，打開分析儀上的光源，運行HICC系列自動菌落計數分析軟件；
    2、點擊軟件中左上角的[聯接]圖標，便立即看到菌落圖（[聯接]圖標被自動換成[拍照]圖標）；
    3、點[拍照]圖標后1秒鐘，即可選擇感興趣分析的菌落區域；
    4、點選菌落分析軟件的相應按鈕，進行自動計算；
    5、自動在結果欄中分類顯示出菌落計數，并標記在屏幕上；
    6、如果需要，可直接點[報告]圖標打印結果，或點[數據表]圖標查看導出的統計分析結果。

    自動菌落計數儀在使用中，需要避免儀器被強烈振動，并遠離液體、水等導電體。需要保證攝像頭鏡頭，以及放平皿的圓形玻璃片上干凈無塵。必要時，用擦鏡紙或麂皮輕柔擦拭。每次使用完畢后，給儀器套上防塵罩。另外，用磁鐵吸附在自動菌落計數儀燈箱側面的擋光板，是為了避免強光直射而設計的，您需要根據現場的光線情況來決定是否要加，以及其擺放的位置。系統具有自學習功能，平時做計數操作時，要注意保存好其學習獲得的各項參數，以便日后遇到同類菌落可以被調出來重用。
    使用注意事項如下：
    1、校準和驗證：在使用前，要進行校準和驗證。校準可以確保準確的菌落計數結果，而驗證則驗證儀器的性能是否符合規范要求。
    2、清潔和消毒：在每次使用前和不同樣品之間，請務進行清潔和消毒。使用適當的清潔劑和消毒液，并按照制造商的指示進行操作。
    3、樣品處理：將待測試的樣品正確加載到儀器中。遵循樣品處理的準確步驟，以確保正確的菌落計數結果。避免污染和交叉感染。
    4、操作安全：使用時，請注意操作安全。遵循使用手冊中的指示，避免觸摸移動部件和熱表面。使用個人防護裝備，如實驗手套和眼睛保護。
    5、數據記錄：記錄每次的使用相關數據，包括樣品信息、操作時間和結果。這有助于追溯和質量控制。
    6、定期維護：按照制造商的建議，進行定期維護和保養。這包括更換零件、清潔傳感器和校準儀器。遵循維護計劃，以確保儀器的長期性能和可靠性。